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Pilze Pilze Forum Archiv 2012-13

Re: Hygrocybe conica ITS-Sequenzierung

Geschrieben von: Haseneier
Datum: 12. November 2012, 20:08 Uhr

Antwort auf: Hygrocybe conica ITS-Sequenzierung (Svampskogen)

: Hallo zusammen

: Anlässlich einer Semesterarbeit sequenziere ich selbst gesammelte
: Kollektionen von Hygrocybe conica. Als Methode ist eigentlich die
: ITS-Sequenzierung gedacht. Jedoch habe ich im Paper von Babos et al., 2011
: (Preliminary notes on dual relevance of ITS sequences and pigments in
: Hygrocybe taxonomy.) gelesen, dass von 6 sequenzierten conicas "five
: of the six ITS sequences were identical". So etwas lese ich natürlich
: nicht besonders gerne :-) Sind jemandem alternative Genloci bekannt, die
: sich für die Sequenzierung von Saftlingen eignen und vielleicht auch schon
: erprobt wurden?
: Vielen Dank schon mal für jeden Tipp!

: Gruss Svampskogen

Hallo Svampskogen,

Gut gewähltes/gestelltes (und anspruchsvolles) Thema für ne Semesterarbeit. Die conica-nigrescens Gruppe hätte ich auch gerne vorrangig genetisch geklärt. Man mag nicht recht glauben, daß das alles ein und dieselbe Art ist.

Da die ungeklärten Abgrenzungen (eigene Art vs. Varietät vs ident) bei Hygrocybe ja meist mit Farbabweichungen Hand in Hand gehen, wäre m.E. der Hit, wenn man die Loci untersucht, welche die Pigmentproduktion codieren. Aber dafür müßte man erst einmal diese Genabschnitte gefunden haben, oder hat man das etwa schon? Detailliertere Antworten auf Deine Frage kann ich aber leider nicht geben.
Danke für den Literaturhinweis (Babos) und ich hoffe, Du berichtest dann hier vom Ergebnis Deiner interessanten Untersuchung.

Brauchst Du noch Untersuchungsmaterial? Reicht 1 mittelgroßer Fk für so eine Analyse aus? Ich habe heuer 1 Conica-Exsikkat angefertigt, weil ich an dem Exemplar auffällig fand, wie zögerlich es schwärzte (es ist auch beim Trocknen nicht komplett schwarz geworden)

Beste Grüße
Martin

Beiträge in diesem Thread

Hygrocybe conica ITS-Sequenzierung -- Svampskogen -- 12. November 2012, 18:49 Uhr
Re: Hygrocybe conica ITS-Sequenzierung -- Haseneier -- 12. November 2012, 20:08 Uhr
Re: Hygrocybe conica ITS-Sequenzierung -- Svampskogen -- 12. November 2012, 20:50 Uhr
Re: Hygrocybe conica ITS-Sequenzierung -- Der Juergen -- 12. November 2012, 22:54 Uhr
Re: Hygrocybe conica ITS-Sequenzierung -- jesko -- 12. November 2012, 23:19 Uhr
Re: Hygrocybe conica ITS-Sequenzierung -- Haseneier -- 13. November 2012, 01:16 Uhr
Re: Zeitüberschreitung -- Wolfgang P. -- 13. November 2012, 22:58 Uhr
Re: Zeitüberschreitung -- Haseneier -- 13. November 2012, 23:51 Uhr
Sequenzierung -- Thüringer-Holz -- 14. November 2012, 01:30 Uhr
Re: Sequenzierung -- Svampskogen -- 14. November 2012, 21:51 Uhr

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