Hallo Svampskogen,

wenn nur 5 von 6 gleich waren, dann gibt's doch gute Chancen, mit ITS was herauszubekommen, wenn auch vielleicht nicht die ganze Wahrheit. Meine bescheidene Laienmeinung dazu ist, dass man, wenn es um die taxonomische Auflösung auf Artebene geht und noch keine umfangreichen methodischen Vorarbeiten im zu untersuchenden Formenkreis vorliegen, doch am besten mit ITS anfangen sollte, bevor man sich auf andere loci stürzt, die in aller Regel nicht besser sind. Also mach erst mal ITS, danach kannste weiterschauen.

VG Jesko

: Hallo zusammen

: Anlässlich einer Semesterarbeit sequenziere ich selbst gesammelte
: Kollektionen von Hygrocybe conica. Als Methode ist eigentlich die
: ITS-Sequenzierung gedacht. Jedoch habe ich im Paper von Babos et al., 2011
: (Preliminary notes on dual relevance of ITS sequences and pigments in
: Hygrocybe taxonomy.) gelesen, dass von 6 sequenzierten conicas "five
: of the six ITS sequences were identical". So etwas lese ich natürlich
: nicht besonders gerne :-) Sind jemandem alternative Genloci bekannt, die
: sich für die Sequenzierung von Saftlingen eignen und vielleicht auch schon
: erprobt wurden?
: Vielen Dank schon mal für jeden Tipp!

: Gruss Svampskogen