Besten Dank allen für die Antworten!

ITS-Sequenzierung werde ich auf jeden Fall machen, einen 2. Genlocus zusätzlich anzuschauen, wäre natürlich aber interessant. An rpb 1 und 2 hatte ich auch schon gedacht, dass Trockenmaterial (was ich benutze) für dem rpb 2 ungeeignet ist, war mir unbekannt.
Vielen Dank Felix für die Auflistung verschiedener Loci!
Vielleicht werde ich den Beitrag auch noch im DGFM-Forum veröffentlichen.

Beste Grüsse Svampskogen

: Hi Svampskogen,

: viel Spaß bei diesem Projekt! Um deine Frage kurz zu beantworten: Wenn du
: merkst das du mit ITS nicht weiterkommst, dann sind momentan folgende Loci
: angesagt: LSU
: rpb2
: rpb1
: atp6
: MCM7
: Elongationfactor

: wobei LSU relativ leicht zu amplifizieren geht.
: Bei rpb2 wirst du bei Trockenmaterial wohl auf Ganit beißen, hier eignet
: sich wohl besser Frischmaterial eingelegt in CTAB-Puffer.

: LG FELIX