: Hallo Bernd,

: danke für Deinen erhellenden Kommentar!
: Den BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) mußte ich jetzt auch erst mal
: gschwind nachgoogeln. Es ist, wie ich glaube verstanden zu haben, ein
: mathemathischer Algorithmus um die Wahrscheinlichkeit genetischer
: Zusammengehörigkeit zu eruieren?
: Ich hab mir den von Dir zitierten Artikel angesehen.Ich muß offen zugeben,
: daß ich diese Claden-Bäume noch nicht richtig "lesen" kann. Wenn
: Du nicht gesagt hättest, daß das zwei "deutlich unterschiedliche
: Sequenzen" sind, wären die für mich einfach nur sehr nah beieinander
: gelegen.
: "Genbank" kannte ich natürlich überhaupt noch nicht! Ich war völlig
: platt, daß da 149 Datensätze zu Pyronema (mit Angabe der auswertenden
: Literatur) vorliegen. Da tun sich wirklich Welten auf, von denen ich keine
: Ahnung habe/hatte!
: Ich war wieder heute an der Brandstelle. Der Pilz breitet sich weiter aus auf
: der Asche. Ich werde mir demnächst wieder eine Probe ziehen und schaun,
: wie er diesmal aussieht.

: Herzliche Grüße,

: Martin

Hallo Martin,
es kommt eigentlich hauptsächlich nur darauf an, ob beide Namen direkt an einem senkrechten Strich dranstehen, ob einer der beiden Namen direkt dransteht und einer mit einer kleinen waagerechten Linie in Abstand steht (sieht dann wie ein "L" aus) oder ob beide Namen mit einem kleinen waagerechten Strich von der senkrechten Linie abstehen (wie beim Großbuchstaben "E", aber ohne den Mittelstrich des E).
In den ersten beiden Fällen wäre der Verdacht gegeben, dass es sich um zwei Aufsammlungen mit der gleichen Sequenz handelt, und im dritten Fall wird deutlich, dass die Sequenzen verschieden sind. In einem solchen Fall wie hier, wo es morphologische Unterschiede gibt, kommt dann noch die Unterschiedlichkeit der Sequenzen als unterstützendes Argument hinzu.

Und genau, ein BLAST ist eine Suche nach gleichen, sehr ähnlichen und nicht ganz so ähnlichen Sequenzen. Quasi eine Ähnlichkeitsanalyse. Allerdings lässt diese Analyse nur Aussagen über sehr ähnliche Pilze zu. Ab einem gewissen Faktor der Unähnlichkeit sind sich die Sequenzen der meisten Pilze einander unähnlich. Zwischen nur etwas unähnlichen und sehr unähnlichen Pilzen kann mit einem BLAST nicht unterschieden werden.
Blasted man Amanita spissa in der UNITE-Datenbank (http://unite.ut.ee), indem man eine Analyse mit der BLASTn-Funktion macht, so kommt etwas sehr plausibles raus: Eine enge Verwandtschaft mit A. franchetii und eine nicht ganz so enge mit A. rubescens. Und dann wird darüberhinaus nur noch eine einzige Gruppe der Unähnlichkeit angegeben, in der sich sowohl die anderen Amanita-Arten als auch Arten anderer Gattungen befinden.

Blasted man Amanita regalis, ergibt sich genau die Abfolge im Verwandtschaftsgrad, wie man es vielleicht aus der pilzkundlichen Praxis ableiten würde: erst nächstverwandt A. muscaria, dann A. pantherina, dann A. gemmata und dann eine einzige große Gruppe der etwas fremden bis sehr fremden Pilze. Blasted man als Gegenprobe Amanita caesarea aus der Genbank, dann sieht man, dass sie nicht in die unmittelbare Nähe von A. muscaria/ regalis gehört.

Wenn es nicht Sequenzen von schlechter Qualität in den Datenbanken gäbe, könnte man noch etwas mehr auf die Ergebnisse geben. So aber muss man aber doch kritisch bleiben.