Re: Hygrocybe conica ITS-Sequenzierung

Hallo Svampskogen,

wenn nur 5 von 6 gleich waren, dann gibt's doch gute Chancen, mit ITS was herauszubekommen, wenn auch vielleicht nicht die ganze Wahrheit. Meine bescheidene Laienmeinung dazu ist, dass man, wenn es um die taxonomische Auflösung auf Artebene geht und noch keine umfangreichen methodischen Vorarbeiten im zu untersuchenden Formenkreis vorliegen, doch am besten mit ITS anfangen sollte, bevor man sich auf andere loci stürzt, die in aller Regel nicht besser sind. Also mach erst mal ITS, danach kannste weiterschauen.

VG Jesko

Hallo zusammen
Anlässlich einer Semesterarbeit sequenziere ich selbst gesammelte
Kollektionen von Hygrocybe conica. Als Methode ist eigentlich die
ITS-Sequenzierung gedacht. Jedoch habe ich im Paper von Babos et al., 2011
(Preliminary notes on dual relevance of ITS sequences and pigments in
Hygrocybe taxonomy.) gelesen, dass von 6 sequenzierten conicas "five
of the six ITS sequences were identical". So etwas lese ich natürlich
nicht besonders gerne Sind jemandem alternative Genloci bekannt, die
sich für die Sequenzierung von Saftlingen eignen und vielleicht auch schon
erprobt wurden?
Vielen Dank schon mal für jeden Tipp!
Gruss Svampskogen