Re: Sequenzierung

Besten Dank allen für die Antworten!

ITS-Sequenzierung werde ich auf jeden Fall machen, einen 2. Genlocus zusätzlich anzuschauen, wäre natürlich aber interessant. An rpb 1 und 2 hatte ich auch schon gedacht, dass Trockenmaterial (was ich benutze) für dem rpb 2 ungeeignet ist, war mir unbekannt.
Vielen Dank Felix für die Auflistung verschiedener Loci!
Vielleicht werde ich den Beitrag auch noch im DGFM-Forum veröffentlichen.

Beste Grüsse Svampskogen

Hi Svampskogen,
viel Spaß bei diesem Projekt! Um deine Frage kurz zu beantworten: Wenn du
merkst das du mit ITS nicht weiterkommst, dann sind momentan folgende Loci
angesagt: LSU
rpb2
rpb1
atp6
MCM7
Elongationfactor
wobei LSU relativ leicht zu amplifizieren geht.
Bei rpb2 wirst du bei Trockenmaterial wohl auf Ganit beißen, hier eignet
sich wohl besser Frischmaterial eingelegt in CTAB-Puffer.
LG FELIX