Re: Leccinum schistophilum

Hallo,

... Die
NCBI-Treffer, die ich mit meinen Sequenzen erhalte, sind von den Autoren
den Bakker,H.C., Gravendeel,B., Noordeloos,M.E. and Kuijper,T.W. Ich denke
da sollte die Artbestimmung schon stimmen?!

ich glaube, das ist nicht der Knackpunkt. Die Datenbankabfrage kann immer nur ein erster Schritt zu einer "molekularen Bestimmung" sein. Eigentlich müsstest Du Deine Sequenz in ihren Baum integrieren, z.B. indem Du Dir alle ähnlichen Sequenzen herunterziehst (bzw. nur die Sequenzen dieser Autoren, wenn es genügend sind) und damit einen eigenen Baum errechnest. Der sollte dann mit der Publikation, für die die anderen in der Datenbank hinterlegten Sequenzen verwendet wurden, verglichen werden, dann kann man versuchen, Schlussfolgerungen zu ziehen. Der einfachere Weg wäre freilich, die Autoren zu bitten, Deine Sequenz in ihren Baum zu integrieren und eine Aussage zur Bestimmung zu treffen. Das dürfte sie nur wenig Mühe kosten.
Ich habe die betreffenden Artikel zu Leccinum gerade nicht präsent. Wurde bislang nur mit einem Locus gearbeitet (dann wohl ITS), muss man natürlich auch hinterfragen, ob dieser Locus geeignet ist bzw. ausreicht, um die Sippenstruktur in der Gattung korrekt abzubilden. Das ist bei ITS von Basidiomyceten zwar in der Mehrzahl der Fälle so, aber keineswegs immer.

Viele Grüße, Jesko